怪盗基德的预告信出现在了北海道函馆斧江财阀的收藏库中这次基德将要盗走的是江戸幕府时期新选组副长土方岁三的日本刀向来追逐奢华宝石的怪盗基德居然会看上刀此时被称作西部名侦探的服部平次和柯南一行人也因为剑道大会来到了函馆在基德执行预告的当日平次看穿了基德的伪装并对其穷追不舍同一时间一具尸体在函馆仓库街被发现尸体的胸口有一个十字伤口搜查中出现了一位被叫做“死之商人”的活跃于亚洲一带的美籍日裔军火商这个人一直在寻找斧江家初代家主藏在函馆的宝藏斧江家江戸幕府战争时代深耕军需产业传说那宝藏是能扭转幕末纷争的强力武器而这宝藏似乎和基德追逐欲盗取的刀有着千丝万缕的联系在基德瞄准刀的同时有一位剑士也在向基德逼近……